FA TO MMI

Indexation de la Référence Génomique grâce à minimap2

$ minimap2 -d /path/to/gh38.mmi /path/to/gh38.fa

Cette commande crée un fichier d'index (.mmi) pour la référence génomique, qui est utilisée pour accélérer l'alignement des séquences (en l'occurence ici le gène hg38).

L'indexation permet à l'outil d'alignement de minimiser le temps nécessaire pour localiser les régions correspondantes dans le génome de référence, optimisant ainsi les performances de l'alignement.