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# Tri et Indexation du BAM

Tri et Indexation du BAM grâce à la création d'un BAI en utilisant samtools

```bash
$ samtools sort /path/to/aligned.bam -o /path/to/sorted_aligned.bam
```

Le tri organise les lectures alignées par leur position chromosomique dans le génome.

***

```bash
$ samtools index /path/to/sorted_aligned.bam
```

 L'indexation permet un accès rapide à des régions spécifiques du fichier BAM trié.

***

Ces étapes facilitent les analyses ultérieures et améliorent les performances lors de l'accès aux données d'alignement.