Application WEB

Cette page est dédié à présenter mon application WEB où je génère le bash de plusieurs workflows utiles dans l'environnement de Nanopore.

Comment ça marche ?

Les techniciens ont la possibilité de sélectionner le workflow adapté à la tâche qu'ils souhaitent exécuter. Ils renseignent ensuite leurs paramètres via différents champs de saisie et peuvent ajouter leur configuration à une liste. Si nécessaire, ils ont la possibilité de créer plusieurs configurations pour exécuter des tâches de manière consécutive. Le site génère alors un script bash que les techniciens peuvent télécharger sur le séquenceur en cliquant sur un bouton dédié, puis l'exécuter. Une fois le script en cours d'exécution sur le séquenceur, la base de données du site se met à jour en temps réel pour refléter l'état d'avancement de l'analyse.

GitHub - Aleksandre80/GenomePilot: Pipelines for Nanopore SequencingGitHub

Démonstration du site